在食品加工车间中，排水沟清洁、 卫生非常关键，如果有严重积水、渗漏、污秽，容易孳生虫害和霉菌而造成食品污染的可能。
同时排水沟是车间与接排水管道系统的重要接口，连接着下水道，外部的害虫、老鼠等可能会从下水道通过地漏进入生产区域。
因此，食品车间的排水沟管理对于食品安全控制也是至关重要。
一、车间的排水要与厂区的排水统筹考虑
不同清洁区采用不同的水沟，一般清洁区和准清洁区采用明沟上面加不锈钢侧栏盖。高清洁区必须做暗沟
因为暗沟难清洗，仅消毒是效果欠佳的；用浅浅的明沟，更便于冲洗、易于监控。
生产车间的室内排水（包括楼层）宜采用无盖板的明沟，且明沟要有一定的宽度（200～300mm）、深度（150 ～400mm）和坡度（大于1%），车间地坪的排水坡度宜为1.5～2%
二、用水管道应保持一定斜度，从洁净区流向非洁净区
污水流向从高清洁区流向低清洁区。设计一定的坡度，是避免水排不净，造成污染
车间排水干管的坡度要考虑排水口的位置，其位置及要兼顾车间排水干管的坡度又要考虑车间排水口下的排水管的深度与厂区排水沟深度的合理位置。不然台风天或雨水多的时候还会发生倒灌。
三、排水管道的材料使用根据工厂实际情况来定，选择最好的方案
应当使用用表面光滑、不渗水的材质，表面要光滑便于清洁。
水泥的不太合适，可以采用内衬自流环氧树脂的做法。
选择瓷砖的比较好，成本不高，也比较符合要求。
不差钱的最好用不锈钢材质的
四、排水管道施工时要平整
不得出现凹凸不平和裂缝，以保证车间排水的通畅，转弯处要有一定的弧度
五、车间排水的地漏要有防固形物进入的措施
车间的地漏应使用U型、S型等有存水的水封，以防虫防臭。
车间中的异味来源之一，就是从地漏逸散到车间各处的。理想的地漏应带有 水封，最好是消毒液封，液封高度在7厘米以上，可以防止反味，类似马桶U型管。但是请注意液位的高度，不要因长时间停产出现蒸发导致液位降低而失效。
车间里若有出现蛾蠓类小飞虫，很可能就是从地漏中出来的，不建议在设备底部装地漏哦。
地漏长期贮水，导致湿度极高，且残渣较多，是生产车间中一个重要的污染源，是微生物尤其是霉菌繁殖的理想乐土。
六、排水沟上应有篦子
七、排水沟的出口要防鼠网罩