生物处理就是利用微生物新陈代谢分解氧化有机物的这一功能，并采取一定的人工措施，创造有利于微生物的生长、繁殖的环境，使微生物大量增殖，以提高其分解氧化有机物的效率，将复杂的有机物分解为简单物质，将有毒物质转化为无毒物质，使废水得到净化，特别是食品工厂产生的废水，使用生物处理法效果非常好。生物处理法分为好氧和厌氧两大类。
在供氧充分、温度适宜、营养物充足的条件下，好氧性微生物大量繁殖，并将水中的有机污染物氧化分解为二氧化碳、水硫酸盐、硝酸盐等简单无机物用这种途径处理废水的方法称作好氧生物处理法。含有碳氧化合物、蛋白质、脂肪、合成洗涤剂的生活污水和有机物废水常用这种方法处理。处理废水时所用的装置有稳定塘法、生物膜法、活性淤泥法等。
①稳定塘法：稳定塘源于早期的氧化塘，故又称氧化塘。用稳定塘法污水中的污染物在池塘处理过程中反应速率和去除效果可达到稳定的水平。
稳定塘可以划分为兼性塘、厌氧塘、好氧高效塘、精制塘、曝气塘等。污水或废水进入塘内后，在细菌、藻类等多种生物的作用下发生物质转化反应，如分解反应、硝化反应和光合反应等，达到降低有机污染成分的目的。稳定塘的深度从十几厘米至数米，水体停留时间一般不超过两个月，能较好地去除有机污染成分。通常是将数个稳定塘结合起来使用，进行污水的一、二级处理。稳定塘法处理污水、废水技术简单、操作简便、维持运行费用少，但占地面积大，一般用于罐头食品厂、乳品厂、肉类加工厂的污水处理。
②生物膜法:生物膜法主要用于从废水中去除溶解性有机污染物，是一种被广泛采用的生物处理方法。即是微生物附着在介质“滤料”表面上，形成生物膜，污水同生物膜接触后，有机污染物溶解并被微生物吸附转化为H2O、CO2、NH3和微生物细胞质，使污水得到净化，所需氧气一般直接来自大气。
生物膜法基本流程:废水如含有较多的悬浮固体时，应先用沉淀池去除大部分悬浮固体后再进入滤池，在生物处理设施中，溶解有机污染物转化为生物膜，生物膜不断脱落下来，随水流入二次沉淀池被沉淀去除。
生物膜法的主要设施是普通生物滤池、生物转盘和生物接触氧化池。
A:普通生物滤池:这种滤池平面一般呈圆形、方形或矩形，由滤料、池壁、排水及布水系统组成。废水通过布水器均匀分布在滤料表面，沿覆盖在滤料表面的生长膜流下，依靠生物膜吸附氧化废水中有机物。氧气由通过滤料间隙的气流供给。
B:生物转盘生物滤池:这种滤池由固定于水平转轴上的若干圆形盘片及废水槽组成.转盘下半部浸没于废水槽内，上半部敞露于空气中，以2～5r/min的速度转动。转盘浸入废水时，盘面上的生物膜吸附废水中的有机物，盘面露出废水后吸收空气中的氧，不断循环交替，使废水中有机物得到净化。乳品、面食加工ㄏ、酿酒厂及调味品厂应用此法处理废水.
C:生物接触氧化池:这种滤池填料淹没在流动的废水中，并不断鼓入空气补充所需溶解氧。滤池所用填料有蜂窝填料、软性纤维填料、弹性填料与组合填料等。生物接触氧化池是目前较为常用的生物膜工艺。
