十万级净化车间设计要考虑合理布置空间面积。十万级净化车间进行合理布局首先要理顺工艺流程，尽量避免迂回往返。作业的平面空间应合理，要做到既有利于操作，又便于维修，闲置面积和空间尽量预留。这样的设置利于合理的分区，防止混杂事故。
还有一个问题应该引起我们的注意：十万级净化车间并不是说越大越好，面积和空间的大小关系着送风量的多少，决定着空调能耗的大小，这样会增加工程的投资成本。但空间面积也不可太小，太小可能不便于操作、维修。所以，设计合理的空间面积应考虑到设备操作、维修的需要。
十万级净化车间设计要考虑提高设备水平。设备的材质、加工精度、密闭程度以及管理制度都与交叉污染有关。所以洁净车间除了合理布局外，提高设备的自动化水平和组成联动的生产线，以减少操作人员，降低人员的活动频率，是防止交叉污染的必要措施。
