在净化工程设计在整厂规划是比较繁琐和复杂的工作，因涉及范围极广，需建筑、水电、空调、环保、防震、制造等各项需专业人才共同规划，尽管不少净化工程设计规划，多需要根据现有的建筑物，然而，为避免失误应尽可能事先确认下列事项（综合考虑）：

1、净化工程洁净度等级的要求。

2、室内压之平衡措施。

3、温湿度的要求。

4、机器设备之必要性。

5、确定生产流程。

6、局部排气之必要性。

7、日后扩充弹性。

8、足够维护保养空间。

9、空调送风方式。

10、员工休息区之安排。

11、设施与动力之配置。

12、室内净高与楼板载重。

12、设备空间与管道间。

14、门窗宜少，气密性要佳。

15、静电、振动及噪音。

16、生产线与活动线少交叉。

17、公害、污染与防灾。

18、安装及运转成本之衡量。